Für gewöhnlich haben solche DVD's "burned in"-Untertitel, sprich, sie sind im Bildmaterial und können nicht abgeschaltet werden. Falls die DVD tatsächlich über de-aktivierbare Untertitel verfügt, die wirklich nur dann angezeigt werden, wenn japanisch gesprochen wird, müsste es dafür auch eine eigene Untertiteldatei auf der DVD geben die du
so in deinen Rip bekommen kannst.
Das ist aber viel Arbeit! Da du mit Auto GoardianKnot eine all-in-one-Lösung benutzt hast, scheinst du von Videobearbeitung nicht all zu viel Ahnung zu haben. Wirst dich schon fragen müssen, ob der Film diesen Aufwand wert ist.