Du hast wohl irgendeine variable (VBR) Audiospur in der Datei mit der das Programm Probleme hat. Beim speichern hast du vermutlich in Wave(also unkomprimiert) gespeichert, deswegen ist die Datei so groß. Du kannst aber unter den Soundoptionen auch Mp3(Lame benötigt) einstellen. Sowieso andere Codes.
Xvid ist das hier:
Xvid - Wikipedia
Du kannst auch in Divx oder Mpeg abspeichern. Ok, mit Virtual Dub nicht in Mpeg. Mußt du nur alles einstellen.