Ist denn dein PeerGuardian mit den aktuellsten IPs gefüttert?
PeerGuardian arbeitet für alle Verbindungen - also auch wenn man z.B. Kazaa oder WinMX benutzt.
Die ipfilter.dat hingegen ist nur mit dem eMule zusammen wirksam. Da gibt es ständig aktualisierte Versionen - man sollte sich also bemühen, die ipfilter.dat immer auf dem neuesten Stand zu halten.