Ich habe das Problem auch seit der Version 12g11b.
Bei mir funktioniert folgender Trick, wenn Emule durch den Mausklick eingefroren ist:
- <Escape> drücken, Emule minimiert zum Icon in der Taskleiste
- Rechtsklick auf das Icon und "Wiederherstellen" bzw. "Restore" auswählen
Vielleicht gibt's ja mal nen Fix, ich fände es schön, wenn der Klick mit der mittleren Maustaste wieder funktionieren würde...