Eine deutsche Tonspur unter ein franz. Film zu legen ist in der Regel nicht das Problem. Da in deinem Fall jedoch Video und Ton unterschiedliche Längen haben, hast du spätestens nach dem ersten Outtake ein Problem.
Das heißt du mußt dir am besten erstmal die Komplette Tonspur, also DE+FR, zusammenstückeln. Das ist natürlich ein ganzes Stück Arbeit die ganzen Szenen zu erwischen, rauszuschneiden und auf die Sekunde genau in die deutsche Tonspur reinzuschneiden. Wahrscheinlich willst du, wenn du mit dem Schneiden fertig bist, den Film nie weider sehen, da du Ihn dann auswendig kennst.
Zum Zusammenschneiden empfehle ich dir ein Programm wie CoolEdit, also einen Wave Editor. Sogar der Nero Wave Editor ist dafür garnichtmal schlecht und sollte vollkommen ausreichen.
Wenn du dann die Tonspur fertig hast, kannst du sie mit VirtualDub oder NanDub unter das Video legen. Hier mußt du dann nur noch den Zeitversatz rausfinden und einstellen.
Kleiner Tip: Mit NanDub kannst du sogar zwei Tonspuren unter das Video legen und somit bei Interesse die origionale Tonspur (FR) zusätzlich behalten. Mit dem VLC-Player (und auch anderen) und sogar so ziemlich allen Heim-DVD Playern mit DivX Unterstützung lassen sich die Tonspuren während des Abspielens wie auf einer DVD wechseln.